大脳皮質の働き－１：意識的な機能（随意的運動、感覚）の中枢です。（「はい吸って、はいて」のような）随意的な呼吸 voluntary respirationでは、脳幹 brainstemの機能が一時的に抑制され、呼吸筋 respiratory musclesに対して直接指令が伝えられます。この経路は内側の延髄 medulla oblongataを通ります。
大脳皮質の働き－２：また、（発声、運動、排便などの）行動 behavior、（驚き、怒りなどの）感情 emotionによっても呼吸は調節されます。
大脳皮質の働き－１、２のために、覚醒時、呼吸リズムの安定度は低いのですが、睡眠によりこれらの作用は弱くなり、延髄のrhythm generatorのためにリズムが安定した呼吸になります。